南京市在走访大批新型研发机构、调研科技创新项目、接洽社会创投机构基础上，借鉴全国先进城市相关规定，制定《南京市级科技创新基金实施细则》。
科创基金主要用于支持“两落地一融合”、新型研发机构及其项目培育、创新型企业和产业培育、人才引进项目培育等，以新型研发机构为主阵地，大力培育科技创新型企业。
科创基金投资方式包括合作子基金投资、直接投资和跟进投资，以合作成立子基金投资为主，直接投资、跟进投资为辅。在管理上，南京市将成立由市长担任主任委员的基金管理委员会，负责确定年度投资重点及方向等。
据介绍，政府鼓励新型研发机构从科创基金中拿钱使用，科创基金投资参股不控股，持股比例一般不超过30%，且不做第一大股东，不参与被投资企业的日常经营管理，直接投资和跟进投资期限一般不超过5年。科创基金在退出时，可优先转让给被投资企业技术团队和管理团队。科创基金取得的投资收益部分50%用于奖励被投资企业的技术团队和管理团队。
